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该实验室依托中国农业科学院哈尔滨兽医研究所，是集应用基础研究和应用研究于一身，以危害畜牧业的动物传染性疾病和人兽共患病为研究目标，运用分子生物学研究动物传染病及人兽共患病病原的遗传变异、致病及其诱导免疫的机制，研制预防、诊断或治疗用细胞工程及基因工程制剂的国家级重点实验室。
该实验室下设动物流感研究室、猪传染病研究室、禽传染病研究室、大动物传染病研究室、人兽共患病研究室、细菌病研究室、实验动物研究室以及基础研究室等8个研究室。2009年，有固定研究人员112人。其中，高级职称48人，中级职称52人，初级职称12人；具有博士学位56人，硕士学位44人；博士生导师17名，硕士生导师41名。2009年，实验室毕业博士研究生16人、硕士研究生81人，在读研究生231人。
2009年，实验室承担国家级、省部级、院市级课题81项。其中，国家自然科学基金面上项目6项，青年科学基金项目7项，国家重点基础研究发展计划（“973”计划）项目7项，国家高技术研究发展计划（“863”计划）项目7项，国家科技支撑计划项目12项，政策引导类科技计划及其他专项工作14项，国际合作项目4项，省部级项目15项，院市级项目6项。全年在各类学术期刊上发表论文263篇，其中SCI收录文章59篇。实验室科研人员主编或参编了《动物基因工程疫苗原理与方法》、《猪病鉴别诊断与防治》、《猪流感及其防治》、《免疫学前沿进展》、《动物病毒反向遗传学》、《现代兽医兽药大全——动物常见传染病防制分册》等8部专着。全年有8项专利获授权，有2项获转基因安全证书。《H5N1亚型禽流感病毒进化、跨宿主感染及致病力分子机制研究》获黑龙江省自然科学一等奖，《猪繁殖与呼吸综合征活疫苗（CH-1R 株）的研制与应用》获黑龙江省科技进步一等奖，《鸡传染性法氏囊病超强毒变异机制及防制技术研究与应用》获神农中华农业科技奖科学研究成果一等奖。
2009年，该实验室接待来自加拿大、英国、美国、埃及、泰国、法国等国24批次、63人次的外国专家及代表团来访，有46位专家以学术报告、座谈等形式与该实验室专家进行学术交流。全年派出28人次赴埃及、土耳其、美国、加拿大、德国、法国、哈萨克斯坦等国参加国际会议或项目考察，扩大了国际影响。
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