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1986年以来，继续开展以治理环境、除"四害"、健康教育和公共卫生为主要内容的爱国卫生运动，取得了较好成绩。截至2005年，有76个单位、4个乡镇、19个村屯被评为省级卫生先进单位、先进村镇。坚持以药物扑杀为主的综合防治措施除"四害"，鼠密度城区控制在1.3%、农村2.5%以下，达到了省定标准；普及健康教育，2005年，全市中小学校健康教育开课率、从业人员卫生知识培训率、健康教育覆盖率均达到了100%，居民健康知识知晓率达到80%，健康行为形成率75%，分别比2000年提高了10个和15个百分点。
坚持全面开展传染病疾情管理工作，每年都对县（市）直属医疗机构、乡镇和厂企卫生院监督监测2次，对村级卫生所监测1次，覆盖面达95%以上，疾情报告率明显上升。2005年疾情报告率为99.84%，比1991年提高了17.8个百分点。同时加大对地方病的防治力度，使甲状腺肿病患显著下降，甲状腺肿大率低于国家规定标准；大骨节病基本消灭，布鲁氏菌病得到控制，只有零星发生。特别是在灾后疫病防治上，医疗卫生部门发挥了不可替代的作用。1991、1994、1998年阿城市发生3次较严重的洪涝灾害。卫生医疗部门共组织医疗防疫人员812人次，深入灾区开展救灾防疫工作，累计义诊体检15.7万人次，投入预防、治疗药物价值71.67万元，确保大灾之后无大疫发生和灾区广大群众的健康。 |
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