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2009年，哈尔滨市自然科学技术学术成果奖评审结果揭晓。共征集到医药、能源、材料、机械、电子等领域的学术成果216项。经哈尔滨市自然科学技术学术成果奖专家评审小组评审及网上公示，《第一性原理研究镧对氮在ε-Fe3N相中扩散的影响及其应用》成果获特等奖，《碳纳米管增韧二硅化钼金属间化合物的研究》等7项成果获一等奖，《基于变频思想的混流式水轮机转轮的水力设计》等22项成果获二等奖，《激光测距技术在车辆超限检测系统中的应用》等35项成果获三等奖。多数获奖成果在国际期刊上发表，具有较高的学术价值。
6月22日，由黑龙江省自然科学技术学术成果奖评审委员会组织开展的第十一届黑龙江省自然科学技术学术成果奖评选结果揭晓。由哈尔滨市科协推荐的20项学术成果中有10项获奖。其中，《银杏叶提取物对局灶性脑缺血—在灌注大鼠突结触素表达的影响》获一等奖，《硬泡聚氨脂外墙保温工程规程》等2项成果获二等奖，《低压系统动态无公补偿装置的研究》等7项成果获三等奖。
6月25日，哈尔滨市南岗知识创新区建设院士专家论坛——2009年知识经济与科技创新专题在南岗区政府举行。来自企业、高校、科研院所的6位院士、4位经济学教授在论坛上作了主题发言。该次论坛旨在贯彻落实黑龙江省委加快推进建设“八大经济区”、实施“十项工程”，发挥院士、专家高端人才智囊作用，探讨在实施高新科技产业开发区建设过程中的资源配置和有关政策问题，助推哈尔滨市南岗知识创新区建设，为促进哈尔滨市经济社会又好又快发展提供智力支撑和有效服务。南岗区作为全省科教资源和优质发展要素最为集聚的城区，坚持围绕“如何充分发挥比较优势，如何打造核心竞争力，如何在新一轮发展中实现跨越与赶超”等问题，进行探索和实践。通过借鉴先进地区的成功经验和在国内外大范围的研究、分析、比较，确立了“城区发展园区化”的发展理念，形成了整合科教资源优势，推进大学校区、科技园区、公共社区的三区联动、打造“哈尔滨南岗知识创新区”的战略构想。
11月27日，哈尔滨市第二届科学技术学术年会在东北农业大学举行。来自哈尔滨市各市级学术团体、区县（市）、企事业单位等部门的科技工作者代表500余人参加了会议。
哈尔滨市创立了自然科学学术界新时期领军人才奖，成立了哈尔滨市首届自然科学学术界新时期领军人才评审工作领导小组，组建了专家组，研究制定了评选办法，组织科研生产第一线的科技工作者报名参评。征集论文、着作、建议315篇。评出特等奖、一等奖和二等奖学术成果共90篇，当中选出66篇，编辑出版《科技创新与现代农业发展——哈尔滨市第二届科学技术学术年会论文集》。经专家组评审，并报领导小组审定和媒体公示，哈尔滨工业大学市政环境工程学院马军等12人被授予哈尔滨市首届自然科学学术界新时期领军人才称号。
11月28日，哈尔滨市科协组织召开的中俄医学高峰论坛在哈尔滨金谷大厦召开。来自全省的医学专家学者及卫生技术人员500余人参加了此次论坛。该次论坛中俄双方就外科腔镜学和超声医学两个学科进行了医学学术交流。邀请俄罗斯的医学专家就超声医学和外科腔镜学的热点和前沿问题进行专题讲座和学术交流，并对各种疑难病例与国内外着名专家进行现场讨论。该次论坛的召开对哈尔滨市医学专家了解和认识最前沿的医学理论、国内外最新动态和最先进的技术创造机会，对哈尔滨市超声医学和外科腔镜学的学科发展和学术进步起到推动作用。
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