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2008年，安徽阜阳爆发手足口病，哈尔滨市也呈多发态势。5月28日，全市召开手足口病防控工作会议，成立了哈尔滨市手足口病防控工作领导小组，并要求各区县（市）政府成立相应的组织机构，落实部门职责，制订下发了《哈尔滨市手足口病防控工作方案》，市、县两级财政共同出资，解决了定点收治医院所需呼吸机的需求。印发了2万册《手足口病防控技术指南》和20万份《手足口病防治知识宣传单》。全市各级疾病控制、卫生监督、妇幼保健、医政管理等部门加大对基层单位和中小学校、幼托机构、医疗机构的督导检查，卫生监督部门就监督检查医疗机构568家次、托幼机构1754家次。落实预检分诊制度，二级以上医疗机构启动感染性疾病门诊，其他医疗机构启动传染病分诊点；指定全市23家医疗机构为定点救治医院；组织开展对各定点救治医院的督导检查；组织开展定点医院医务人员手足口病诊疗技术的集中培训。5月31日，由市儿童医院八名队员组成的应急医疗队赴安徽阜阳支援当地手足口病医疗救治工作。6月14日，市儿童医院赴安徽阜阳执行医疗救援任务的应急医疗队完成任务返回哈尔滨。
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