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2009年，市科协实施“一二三四”发展战略，即实现一个转变：把科协工作重心转向经济发展主战场；进入两个阵地：发挥科协特殊作用，进入新农村建设阵地和企业技术创新阵地；实施三个工程：人才强市工程、学术高地工程、科普品牌工程；完善四个基础：加强基层组织建设、加强科技工作者之家建设、加强科协形象建设、加强科协队伍建设。
1月15日，由哈尔滨市科协承办的全国城市科协第十七届主席年会在哈尔滨马迭尔宾馆召开。省科协党组成员、副主席杨铭铎，市委常委、宣传部部长朴逸出席会议并讲话。市人大常委会副主任才殿国、市政府副市长王莉以及来自深圳、西安、成都、沈阳等24个地市科协的100余名代表出席会议。
2月10日，哈尔滨市科协以“发挥科技群团优势，推动经济平稳较快发展”为主题在市教育宾馆召开六届三次全委会议，市委常委、宣传部部长朴逸出席会议并讲话。市科协六届委员、常委、副主席100余人参加了会议。会议传达了《中央书记处关于科协工作的几点意见》、中国科协七届四次全委会议、2008年黑龙江省科协工作会议精神；增补了市科协第六届委员会委员、常委、副主席；研究部署了市科协2009年工作，市科协党组书记、常务副主席孙鸿达作了题为《拓展发展空间，提升服务水平，为推动全市经济平稳较快发展做出新贡献》的工作报告。
2009年1月12日，哈尔滨市“三下乡”活动启动仪式在五常市进行，市委常委、宣传部部长朴逸出席启动仪式并讲话。在启动仪式上，市科协、市委宣传部等15家单位为当地群众赠送了微机、科普图书等价值30余万元物资，并组织开展了文艺演出、农业种植技术讲座、农村法律咨询、医疗咨询义诊等服务活动。2009年，市科协开展以“科技科普服务三农，创优创新推动发展”为主要内容的社会主义新农村“两科两创”工作体系建设。并以农民技能学校、科技惠农信息网络、科技专业合作社、示范农村专业技术协会建设、“百千万”工程等活动为载体和平台，推进农业科技推广，加速科技创新成果转化，集中探索“三下乡”活动长效机制。
2009年，黑龙江省青少年航模培训基地正式迁入哈尔滨科学宫，成为科学宫新增的第五个青少年科学工作室，该特色项目面向全市中小学生开放。哈尔滨科学宫青少年工作室是黑龙江省第一批成立的专项科学工作室，开设有机器人、多媒体、小发明小制作、思维训练和航空航天模型制作这五大类别的特色工作室。科学工作室自2006年8月对外开放以来，以面向全市中小学生开展科普宣传教育为宗旨，培养学生动手动脑能力和训练逻辑思维能力，至今已开展上百次丰富多彩的科普教学和实践活动，受到少年儿童及家长的普遍欢迎。科学宫组建了航模制作工作室，面向全市少年儿童开展科普培训。
3月25日，哈尔滨市全民科学素质纲要实施工作联席会议在黑龙江省科学会堂召开。副市长王莉出席会议并讲话。全市科学素质工作联席会议成员单位主管领导及负责人50余位参加了会议。 会议审议通过了《哈尔滨市全民科学素质行动2009年工作要点》，通报了上年度全市科学素质工作考核结果。5月13日、14日和19日，市人大副主任才殿国带领视察组先后深入到阿城区、南岗区、延寿县的部分中小学校、农民科技养殖合作社、居民社区、职业技能培训基地等进行实地视察，并听取了市纲要办关于实施《纲要》工作、市财政局关于科普经费投入等情况的汇报。
2009年4月12日，由市科协、哈尔滨理工大学、《新晚报》共同主办的以“帮助大学生就业，服务哈尔滨经济”为主题的2009科技人才招聘会在哈尔滨理工大学举行。市委常委、宣传部部长朴逸在开幕式上讲话，市人大常委会副主任才殿国、市政协副主席肖鸿麟、市政府副秘书长季卫国、哈尔滨理工大学校长李大勇出席开幕式。开幕式由市科协党组书记、常务副主席孙鸿达主持。
2009年，中国科协和中央电视台联合举办了全国第三届大众科学素质电视大奖赛，由市科协选派的哈尔滨市第七十六中学教师何龙、学生于卓妹，道里区通江街道红专社区居民于济宁3人组成参赛队伍，代表黑龙江省获得本次大奖赛一等奖，取得了黑龙江省参加全国大众科学素质电视大奖赛以来最好成绩。7月19～24日，哈尔滨市选手在第二十四届全国青少年科技创新大赛上，所参加的7个项目全部获奖，其中获优秀学生项目一等奖3项，二等奖1项，三等奖3项；获优秀科技实践活动一等奖2项，二等奖1项；优秀科技辅导教师称号1名；优秀科幻画5幅；哈尔滨市科学技术协会获第二十四届全国青少年科技创新大赛省级基层赛事优秀组织奖称号。
2009年，市科协创建“两科两创”工作体系建设，以“科技科普服务三农，创优创新推动发展”为主体，服务社会主义新农村建设。9月17日，在五常市召开“两科两创”工作会议，五常市委、市政府，道里区科协，阿城区科协，依兰县科协和方正县科协介绍了经验。至年末，哈尔滨市新成立各类农村专业技术协会144个，入会农民23514户；创办科技专业合作社125个，投入股金6619.4万元，入社农民14139户，农民增收7万元；农技协和科技专业合作社共推广新技术484项，实现农民增收2.06亿元。
哈尔滨市科协获得2009年全国科普“站、栏、员”（科普工作站、科普宣传栏、科普宣传员）建设优秀单位称号，获奖励资金3万元。获全省科普之冬20年先进集体标兵称号，获价值5万元的奖品。哈尔滨五常水稻协会等3个协会被授予全省优秀农技协称号；依兰县红菇娘种植协会等3个科技协会会长被授予优秀农技协领头人称号。在国家及省“科普惠农兴村计划”评选中，哈尔滨市3个农村专业技术协会、1个农村科普示范基地和2名农村科普带头人获得国家级奖励；2个农村专业技术协会和1名农村科普带头人获得省级奖励，获奖资金100万元。组织成立哈尔滨市科普惠农兴村计划科技专家报告团，在双城、方正等4个县（市）举办水稻种植、中草药栽培、食用菌种植等科普惠农兴村科技报告5次，受益农民1782人。中国科协网站于11月10日刊发了市科协的做法。市科协创建科技专业合作社，受到了入社农民的欢迎和中国科协、市委领导及新闻媒体关注。市委副书记王颖，市委常委、宣传部部长朴逸分别对科技专业合作社创建工作作出重要批示；中国科协《科普动态》2009年第五期全文刊载了《哈尔滨市科协关于创建和优化农村新型科技经济组织的情况报告》。《哈尔滨市科协关于创建科技专业合作社情况报告》被评为第十一届中国科协年会中国农技协分会场农民专业合作组织与农村改革发展研讨会优秀论文。中国科协农技中心副主任张晓军到哈尔滨市，对道里区永盛果类科技专业合作社、太安奶牛科技专业合作社、万顺花卉科技专业合作社和阿城区众鑫畜禽科技养殖专业合作社进行专题调研。10月25日，《人民日报》在第六版以《哈尔滨市科协支农有新招》为题，刊发哈尔滨市科协创建农村科技专业合作社的经验和做法。
2009年，哈尔滨市创建农民技能学校48所，投入办学资金550.7万元，开设技术培训、科技讲座943期次，培训农民73094人，教学和培训内容涵盖了种植养殖技术、农产品加工、劳务输出技能、绿色生态环保、卫生保健等多个方面，满足了农民群众的需求。道里区在实施“两科两创”中新建实训基地4个。方正县科协以农广校为主体，科技园区、示范基地为补充，外聘东北农业大学专家与科技示范户相结合，开展实用技能培训57期，培训农民1700人次，提高会员科学文化素质。2009年，全市新建科技信息服务站165个，有近30万人次通过网络查询信息和技术。共发布农事农情、产品供求、病虫害防治及种养新技术、致富项目2381条，通过远程科普网络和科普专家服务站推广新技术360个，帮助农民增收1519万元。
2009年，市科协在“百名专家进千村、科学技术惠万民”活动中，联系协调省、市大专院校、科研院所的部分农业科技专家，开展了科技专家工作站活动。全市共创建科技专家工作站32个，聘请专家964人，举办技术培训754期次，为31984户农民提供免费服务。全市通过科技专家服务站推广新技术411项，新技术推广面积13.73万公顷，农民增收2.71亿元。科技专家工作站的建立，为促进农业稳定发展、农民持续增收奠定了基础。
市科协在南岗区召开“十星”科普社区创建现场会，对全市社区负责人进行培训，并对创建情况进行检查。通过“十星”科普社区建设、“科普之冬”、科普大集，强力打造民生科普品牌，先后组织开展各类科普培训、讲座、咨询、宣传活动1500余次，受众达3万余人次，发放各类科普挂图、科普图书、科普光碟、宣传单6万余份。在纪念中国科协成立50周年、全国科普日等重大纪念日，开展科普知识宣讲、科普咨询、科普广场活动92场次；下发各类科普宣传单2万余份；7所学校成为中小学生科普教育基地，举办科技百科知识竞赛活动，培养青少年学习科学知识的兴趣。红旗乡、王岗镇依托农民技能学校、“站、栏、员”（科普工作站、科普宣传栏、科普宣传员），开展各类农业实用技术培训班24期，培训农民4500人次，邀请美籍农业博士陈明伟、省农业专家，针对饲料级微生物添加剂AMX产品的产业化一系列问题进行详细讨论并交换意见。2009年，南岗区8个社区被评为黑龙江省第三批科普示范社区。道里区科协投资创办10个科普体验驿站，并向居民免费开放。道里区实施的社区科普体验驿站获得全国百县百项科普示范特色建设专项优秀奖。
2009年，针对甲流防控严峻形势，市科协开展防控甲型H1N1流感系列科普宣传活动。与市卫生局联合于“五一”期间编排、印制相关疫情防控科学知识宣传资料10万份，免费发放到全市所有的区域。组织举办松北区、道里区甲型H1N1流感防控知识科普讲坛6场，道里区科协和哈尔滨科学宫在中央大街展出预防甲型H1N1流感大型科普知识展，编辑出版走进科学——社区科普知识系列丛书5万册。
市科协组织在哈尔滨的专家学者进行专题研讨，并将一些好的对策建议通过《科学家之声》及时反馈给市委、市政府有关领导。2009年，征集编发《科学家之声》6期，其中，关于虫害防治、翻浆道路防治等建议引起市领导重视，市委书记杜宇新、市政协副主席魏伟等作了重要批示。
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