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2009年，哈尔滨市三大作物入库种子7176.2万公斤。其中，玉米种子入库4246.7万公斤，下拨3893.3万公斤，库存353.4万公斤；大豆种子入库1783.3万公斤，下拨1701.6万公斤，库存81.7万公斤；水稻种子入库1846.8万公斤，下拨1797.6万公斤，库存49.2万公斤。
第一、二积温带玉米品种居多，大豆、水稻种子数量充足。玉米种子价格总趋势略高于上年。第一、二积温带品种价格略有上涨，第三积温带品种价格持平，个别品种下降，市场畅销的“先玉335”、“吉单519”、“吉单27”、“鑫鑫1号”、“哈丰2号”、“吉东28”等品种的零售价格比上年上涨0.8元～1元/公斤，平均价格14元～16元/公斤；普通老品种“四早113”、“绥玉7”、“本育九”的零售价格平均在5.2元～6元/公斤。水稻种子价格呈现由低走高的态势，主要是受商品稻价格的涨幅影响，带动水稻种子的销售旺市，零售价平均在3.6元～4元/公斤，比上年上涨0.6元～1元/公斤。大豆种子以“黑农44”、“黑农46”、“黑农48”、“合丰50”、“合丰55”、“垦丰16”等品种为主导，市场的销售价格平均在4.4元～5.4元/公斤，与上年持平。农民选购种子主要以粮食收购指标作为衡量尺度，第一、二积温带“先玉335”、“吉单519”、“鑫鑫2号”、“吉单27”等玉米种子销售形势明显好于其他品种。“鑫鑫2号”、“久龙14”等玉米品种在市场供应中占据主导地位。全市种子销售普遍迟缓。农民选购种子的积极性不高，种子销售前期非常冷淡，直到4月末才进入购种高峰。播种结束后，受大风干旱气候影响，玉米、大豆苗小、缺苗现象严重，全市补种中早熟玉米种子193.2万公斤，补种早熟大豆种子160万公斤。
2009年，哈尔滨市种子管理推行五项机制。一是推行经营资格审验制。坚持生产、经营许可证的核发制度，对经营资格、场所、加工仓储、检验仪器等必要条件进行实地考察，对符合条件的按照规定及时办理，发放种子经营许可证8个，种子生产许可证3个。二是推行种子质量抽检制。全市抽检种子经营企业390个，扦取种子样品929份，总代表数量1564.84万公斤。其中，蔬菜种子50份，代表数量0.59万公斤；粮田种子879份，代表数量1564.25万公斤。经检验合格样品901份，抽检合格率97%。三是推行农资档案制。对全市农资企业调查摸底和逐户登记，要求每个企业要对生产、经营品种、数量及销售去向等内容建立档案，逐步实现可追溯管理。四是推行部门配合联动机制。市级和区县（市）级均成立由农委、工商、技术监督、公安等部门组成的农资打假领导小组和办公室。市级查处种子违法违规案件14起，罚款3.4万元，没收种子8924公斤。五是推行农资投诉快速反应机制。全年受理投诉案件42起，接待上访投诉农民345人次。其中，调解达成协议36起，组织专家鉴定6起，挽回经济损失57万元。
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