哈尔滨医科大学附属第二医院创建于1954年10月8日。由内、外专科医院调整，合并而成，为哈尔滨医科大学综合性临床教学医院之一，是省内最大的医院。
该院建筑面积7．5万平方米，布局为分散式，其中医疗用房4万平方米。占地面积50万平方米。病房主楼四层，教学楼三层，为绿色玻璃瓦大屋顶建筑，其斗拱，翘脊别具一格，颇有民族风格。新建门诊五层楼，样式新颖，布局科学，医院内绿化带占地面积近总面积的三分之二。可谓绿树成荫，环境优雅，医疗并行的良好场所。
该院现有职工1720人，其中副教授、副主任医师以上的高级知识分子96名；讲师、主治医师170名，住院医师220名；护理师123名。一批造诣较深的老教授曾留学美国、日本、苏联、瑞士，在国内外享受一定声誉。
该院设有25个临床科室，13个医技科室，现有床位1000张。拥有第一、第二住院部，内科楼、传染科楼、神经、中医科楼。设有中医科病房，以西医为主，中西医结合，对胶原病的研究和治疗很有进展。并建立血液科无菌病房，省血液透析中心，影象诊断中心，变态反应中心。独立了输血科，开展了成份输血。建立了老年病病房，开展了老化测定等几项研究，医院除普通门诊外，还开设了37个专科门诊，如疼痛门诊。平均日门诊量2000多人次。全年门诊病人达50万。住院患者达1．5万人之多。手术人次达5千。全院开展了110项多种具实用价值的新业务、新技术、新疗法，使许多疑难病的诊断和急重病的抢救成活率大幅度提高，治疗有效率达91．35％，抢救成活率已达80％。
该院设有3个研究所，21个实验室。每年撰写论文近500篇，分别发表在国内外及地方性刊物上。该院注意国内外学术交流，不断提高科学技术水平，出席国际、国内学术会议。分别邀请：美国、日本等国专家来该院讲学和进行技术指导工作。30年来共获国家级、省级科研成果计52项。
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